「君に勇者になる素質はあるか？」――自らを「宇宙の賢者」と名乗る謎の男「サスカル」が主人公ユーマに告げた言葉から、戦いの始まりが訪れる。彼はユマに想像を超える究極の試練を与える。 「失敗すれば、アーチャーの力を失うことになる…」怪獣防災科学研究所「SKIP」の一員として星遠市の平和を守ること、「SKIP」に集まった仲間たちと築いた信頼の絆、怪獣を倒す意味…これらが絡み合い、ウルトラマンに変身できる光を手に入れたからこそ、そしてサスカルに翻弄される今、ユーマは次々と降りかかる重たいミッションを一人で背負うことしかできない！凶暴な大怪獣、邪悪な宇宙人、時空すらも歪む超次元に、黒いアーチャーのウルトラマン――「キルアーチャー」が現れた。ユマ＝ウルトラマンエーカーは“想像”を超えた究極の試練を乗り越え、未来を守ることができるのか！？